Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA2

Gm28051, Predicted gene, 28051, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28051J3QMA2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms