Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU2

Gm21820, Predicted gene, 21820, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21820J3KMU2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm21820J3KMU2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm21820J3KMU2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm21820J3KMU2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm21820J3KMU2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm21820J3KMU2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm21820J3KMU2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm21820J3KMU2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm21820J3KMU2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm21820J3KMU2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm21820J3KMU2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm21820J3KMU2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21820J3KMU2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21820J3KMU2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21820J3KMU2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21820J3KMU2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21820J3KMU2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21820J3KMU2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21820J3KMU2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21820J3KMU2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21820J3KMU2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21820J3KMU2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21820J3KMU2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21820J3KMU2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21820J3KMU2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm21820J3KMU2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm21820J3KMU2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm21820J3KMU2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm21820J3KMU2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm21820J3KMU2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm21820J3KMU2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm21820J3KMU2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm21820J3KMU2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm21820J3KMU2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm21820J3KMU2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm21820J3KMU2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm21820J3KMU2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm21820J3KMU2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm21820J3KMU2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm21820J3KMU2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm21820J3KMU2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm21820J3KMU2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm21820J3KMU2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm21820J3KMU2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm21820J3KMU2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm21820J3KMU2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm21820J3KMU2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm21820J3KMU2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm21820J3KMU2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm21820J3KMU2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm21820J3KMU2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm21820J3KMU2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm21820J3KMU2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm21820J3KMU2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm21820J3KMU2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm21820J3KMU2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm21820J3KMU2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm21820J3KMU2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm21820J3KMU2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm21820J3KMU2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm21820J3KMU2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm21820J3KMU2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm21820J3KMU2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm21820J3KMU2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm21820J3KMU2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm21820J3KMU2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm21820J3KMU2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm21820J3KMU2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm21820J3KMU2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm21820J3KMU2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm21820J3KMU2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm21820J3KMU2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm21820J3KMU2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm21820J3KMU2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm21820J3KMU2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm21820J3KMU2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm21820J3KMU2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm21820J3KMU2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm21820J3KMU2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm21820J3KMU2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm21820J3KMU2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm21820J3KMU2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm21820J3KMU2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm21820J3KMU2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm21820J3KMU2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm21820J3KMU2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm21820J3KMU2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm21820J3KMU2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm21820J3KMU2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm21820J3KMU2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm21820J3KMU2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm21820J3KMU2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm21820J3KMU2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm21820J3KMU2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm21820J3KMU2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm21820J3KMU2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm21820J3KMU2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm21820J3KMU2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm21820J3KMU2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gm21820J3KMU2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
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