Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf4bG5E8Z2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf4bG5E8Z2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf4bG5E8Z2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf4bG5E8Z2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf4bG5E8Z2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf4bG5E8Z2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf4bG5E8Z2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf4bG5E8Z2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Taf4bG5E8Z2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Taf4bG5E8Z2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Taf4bG5E8Z2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Taf4bG5E8Z2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Taf4bG5E8Z2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Taf4bG5E8Z2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Taf4bG5E8Z2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Taf4bG5E8Z2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Taf4bG5E8Z2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Taf4bG5E8Z2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Taf4bG5E8Z2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Taf4bG5E8Z2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Taf4bG5E8Z2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Taf4bG5E8Z2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Taf4bG5E8Z2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Taf4bG5E8Z2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Taf4bG5E8Z2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Taf4bG5E8Z2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Taf4bG5E8Z2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Taf4bG5E8Z2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Taf4bG5E8Z2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Taf4bG5E8Z2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Taf4bG5E8Z2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Taf4bG5E8Z2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Taf4bG5E8Z2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Taf4bG5E8Z2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Taf4bG5E8Z2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Taf4bG5E8Z2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Taf4bG5E8Z2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Taf4bG5E8Z2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Taf4bG5E8Z2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Taf4bG5E8Z2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Taf4bG5E8Z2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Taf4bG5E8Z2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Taf4bG5E8Z2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Taf4bG5E8Z2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Taf4bG5E8Z2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Taf4bG5E8Z2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Taf4bG5E8Z2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Taf4bG5E8Z2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Taf4bG5E8Z2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Taf4bG5E8Z2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Taf4bG5E8Z2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Taf4bG5E8Z2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Taf4bG5E8Z2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Taf4bG5E8Z2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Taf4bG5E8Z2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Taf4bG5E8Z2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Taf4bG5E8Z2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Taf4bG5E8Z2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Taf4bG5E8Z2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Taf4bG5E8Z2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Taf4bG5E8Z2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Taf4bG5E8Z2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Taf4bG5E8Z2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Taf4bG5E8Z2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Taf4bG5E8Z2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Taf4bG5E8Z2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Taf4bG5E8Z2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Taf4bG5E8Z2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Taf4bG5E8Z2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Taf4bG5E8Z2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Taf4bG5E8Z2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Taf4bG5E8Z2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Taf4bG5E8Z2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Taf4bG5E8Z2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Taf4bG5E8Z2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Taf4bG5E8Z2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Taf4bG5E8Z2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Taf4bG5E8Z2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Taf4bG5E8Z2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Taf4bG5E8Z2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Taf4bG5E8Z2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Taf4bG5E8Z2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Taf4bG5E8Z2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Taf4bG5E8Z2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Taf4bG5E8Z2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Taf4bG5E8Z2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Taf4bG5E8Z2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Taf4bG5E8Z2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Taf4bG5E8Z2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Taf4bG5E8Z2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Taf4bG5E8Z2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Taf4bG5E8Z2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Taf4bG5E8Z2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Taf4bG5E8Z2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Taf4bG5E8Z2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Taf4bG5E8Z2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Taf4bG5E8Z2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Taf4bG5E8Z2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Taf4bG5E8Z2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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