Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933406M09RikG3XA12 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4933406M09RikG3XA12 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
4933406M09RikG3XA12 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4933406M09RikG3XA12 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
4933406M09RikG3XA12 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
4933406M09RikG3XA12 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
4933406M09RikG3XA12 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
4933406M09RikG3XA12 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4933406M09RikG3XA12 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933406M09RikG3XA12 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933406M09RikG3XA12 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933406M09RikG3XA12 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933406M09RikG3XA12 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933406M09RikG3XA12 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
4933406M09RikG3XA12 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933406M09RikG3XA12 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933406M09RikG3XA12 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933406M09RikG3XA12 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
4933406M09RikG3XA12 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
4933406M09RikG3XA12 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
4933406M09RikG3XA12 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
4933406M09RikG3XA12 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
4933406M09RikG3XA12 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4933406M09RikG3XA12 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4933406M09RikG3XA12 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933406M09RikG3XA12 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933406M09RikG3XA12 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933406M09RikG3XA12 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933406M09RikG3XA12 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933406M09RikG3XA12 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933406M09RikG3XA12 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933406M09RikG3XA12 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933406M09RikG3XA12 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933406M09RikG3XA12 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933406M09RikG3XA12 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933406M09RikG3XA12 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933406M09RikG3XA12 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933406M09RikG3XA12 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933406M09RikG3XA12 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933406M09RikG3XA12 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933406M09RikG3XA12 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933406M09RikG3XA12 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933406M09RikG3XA12 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933406M09RikG3XA12 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933406M09RikG3XA12 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4933406M09RikG3XA12 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4933406M09RikG3XA12 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
4933406M09RikG3XA12 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4933406M09RikG3XA12 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4933406M09RikG3XA12 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933406M09RikG3XA12 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933406M09RikG3XA12 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933406M09RikG3XA12 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
4933406M09RikG3XA12 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933406M09RikG3XA12 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933406M09RikG3XA12 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933406M09RikG3XA12 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933406M09RikG3XA12 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933406M09RikG3XA12 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933406M09RikG3XA12 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933406M09RikG3XA12 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
4933406M09RikG3XA12 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933406M09RikG3XA12 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4933406M09RikG3XA12 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4933406M09RikG3XA12 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4933406M09RikG3XA12 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4933406M09RikG3XA12 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
4933406M09RikG3XA12 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
4933406M09RikG3XA12 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4933406M09RikG3XA12 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
4933406M09RikG3XA12 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4933406M09RikG3XA12 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
4933406M09RikG3XA12 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
4933406M09RikG3XA12 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4933406M09RikG3XA12 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4933406M09RikG3XA12 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
4933406M09RikG3XA12 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4933406M09RikG3XA12 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
4933406M09RikG3XA12 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
4933406M09RikG3XA12 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4933406M09RikG3XA12 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4933406M09RikG3XA12 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4933406M09RikG3XA12 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4933406M09RikG3XA12 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4933406M09RikG3XA12 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4933406M09RikG3XA12 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
4933406M09RikG3XA12 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
4933406M09RikG3XA12 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4933406M09RikG3XA12 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4933406M09RikG3XA12 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4933406M09RikG3XA12 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
4933406M09RikG3XA12 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
4933406M09RikG3XA12 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4933406M09RikG3XA12 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4933406M09RikG3XA12 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4933406M09RikG3XA12 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4933406M09RikG3XA12 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
4933406M09RikG3XA12 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4933406M09RikG3XA12 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms