Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M1F7CXU4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2-M1F7CXU4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2-M1F7CXU4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2-M1F7CXU4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M1F7CXU4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M1F7CXU4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M1F7CXU4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M1F7CXU4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-M1F7CXU4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-M1F7CXU4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-M1F7CXU4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-M1F7CXU4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-M1F7CXU4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-M1F7CXU4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-M1F7CXU4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-M1F7CXU4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-M1F7CXU4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-M1F7CXU4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M1F7CXU4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M1F7CXU4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M1F7CXU4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M1F7CXU4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms