Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Igkv1-99F6XWB2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Igkv1-99F6XWB2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Igkv1-99F6XWB2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Igkv1-99F6XWB2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Igkv1-99F6XWB2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Igkv1-99F6XWB2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Igkv1-99F6XWB2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Igkv1-99F6XWB2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Igkv1-99F6XWB2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Igkv1-99F6XWB2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Igkv1-99F6XWB2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Igkv1-99F6XWB2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Igkv1-99F6XWB2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Igkv1-99F6XWB2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Igkv1-99F6XWB2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Igkv1-99F6XWB2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Igkv1-99F6XWB2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Igkv1-99F6XWB2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Igkv1-99F6XWB2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Igkv1-99F6XWB2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Igkv1-99F6XWB2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Igkv1-99F6XWB2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Igkv1-99F6XWB2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Igkv1-99F6XWB2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Igkv1-99F6XWB2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Igkv1-99F6XWB2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Igkv1-99F6XWB2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Igkv1-99F6XWB2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Igkv1-99F6XWB2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Igkv1-99F6XWB2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Igkv1-99F6XWB2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Igkv1-99F6XWB2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Igkv1-99F6XWB2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms