Protein–RNA interactions for Protein: F6SG70

Gm28374, Predicted gene 28374 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28374F6SG70 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm28374F6SG70 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm28374F6SG70 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm28374F6SG70 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm28374F6SG70 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm28374F6SG70 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm28374F6SG70 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm28374F6SG70 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm28374F6SG70 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm28374F6SG70 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm28374F6SG70 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm28374F6SG70 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm28374F6SG70 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm28374F6SG70 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm28374F6SG70 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28374F6SG70 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28374F6SG70 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28374F6SG70 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28374F6SG70 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28374F6SG70 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28374F6SG70 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28374F6SG70 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28374F6SG70 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28374F6SG70 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28374F6SG70 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28374F6SG70 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28374F6SG70 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28374F6SG70 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28374F6SG70 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28374F6SG70 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28374F6SG70 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28374F6SG70 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28374F6SG70 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28374F6SG70 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28374F6SG70 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28374F6SG70 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28374F6SG70 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28374F6SG70 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28374F6SG70 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28374F6SG70 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28374F6SG70 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28374F6SG70 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28374F6SG70 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28374F6SG70 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28374F6SG70 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28374F6SG70 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28374F6SG70 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28374F6SG70 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm28374F6SG70 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm28374F6SG70 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm28374F6SG70 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm28374F6SG70 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm28374F6SG70 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28374F6SG70 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28374F6SG70 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28374F6SG70 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28374F6SG70 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28374F6SG70 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28374F6SG70 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28374F6SG70 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28374F6SG70 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28374F6SG70 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28374F6SG70 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28374F6SG70 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28374F6SG70 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28374F6SG70 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28374F6SG70 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28374F6SG70 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28374F6SG70 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28374F6SG70 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28374F6SG70 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28374F6SG70 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28374F6SG70 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28374F6SG70 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28374F6SG70 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28374F6SG70 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28374F6SG70 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28374F6SG70 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28374F6SG70 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28374F6SG70 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28374F6SG70 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28374F6SG70 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28374F6SG70 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28374F6SG70 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28374F6SG70 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28374F6SG70 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28374F6SG70 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28374F6SG70 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28374F6SG70 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28374F6SG70 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28374F6SG70 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28374F6SG70 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28374F6SG70 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28374F6SG70 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28374F6SG70 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28374F6SG70 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28374F6SG70 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28374F6SG70 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28374F6SG70 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28374F6SG70 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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