Protein–RNA interactions for Protein: F6S200

Plekhg1, Pleckstrin homology domain-containing, family G (with RhoGef domain) member 1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plekhg1F6S200 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Plekhg1F6S200 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Plekhg1F6S200 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Plekhg1F6S200 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Plekhg1F6S200 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Plekhg1F6S200 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Plekhg1F6S200 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Plekhg1F6S200 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Plekhg1F6S200 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Plekhg1F6S200 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Plekhg1F6S200 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Plekhg1F6S200 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Plekhg1F6S200 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Plekhg1F6S200 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Plekhg1F6S200 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Plekhg1F6S200 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Plekhg1F6S200 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Plekhg1F6S200 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Plekhg1F6S200 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Plekhg1F6S200 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Plekhg1F6S200 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Plekhg1F6S200 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Plekhg1F6S200 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Plekhg1F6S200 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Plekhg1F6S200 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Plekhg1F6S200 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Plekhg1F6S200 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Plekhg1F6S200 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Plekhg1F6S200 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Plekhg1F6S200 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Plekhg1F6S200 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Plekhg1F6S200 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Plekhg1F6S200 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Plekhg1F6S200 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Plekhg1F6S200 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Plekhg1F6S200 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Plekhg1F6S200 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Plekhg1F6S200 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Plekhg1F6S200 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Plekhg1F6S200 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Plekhg1F6S200 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Plekhg1F6S200 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Plekhg1F6S200 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Plekhg1F6S200 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Plekhg1F6S200 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Plekhg1F6S200 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Plekhg1F6S200 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Plekhg1F6S200 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Plekhg1F6S200 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Plekhg1F6S200 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Plekhg1F6S200 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Plekhg1F6S200 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Plekhg1F6S200 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Plekhg1F6S200 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Plekhg1F6S200 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Plekhg1F6S200 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Plekhg1F6S200 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Plekhg1F6S200 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Plekhg1F6S200 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Plekhg1F6S200 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Plekhg1F6S200 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Plekhg1F6S200 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Plekhg1F6S200 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Plekhg1F6S200 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Plekhg1F6S200 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Plekhg1F6S200 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Plekhg1F6S200 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Plekhg1F6S200 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Plekhg1F6S200 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Plekhg1F6S200 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Plekhg1F6S200 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Plekhg1F6S200 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Plekhg1F6S200 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Plekhg1F6S200 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Plekhg1F6S200 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Plekhg1F6S200 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Plekhg1F6S200 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Plekhg1F6S200 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Plekhg1F6S200 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Plekhg1F6S200 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Plekhg1F6S200 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Plekhg1F6S200 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Plekhg1F6S200 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Plekhg1F6S200 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Plekhg1F6S200 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Plekhg1F6S200 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Plekhg1F6S200 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Plekhg1F6S200 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Plekhg1F6S200 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Plekhg1F6S200 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Plekhg1F6S200 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Plekhg1F6S200 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Plekhg1F6S200 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Plekhg1F6S200 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Plekhg1F6S200 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Plekhg1F6S200 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Plekhg1F6S200 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Plekhg1F6S200 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Plekhg1F6S200 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Plekhg1F6S200 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms