Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lmod3E9QA62 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lmod3E9QA62 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lmod3E9QA62 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Lmod3E9QA62 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lmod3E9QA62 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lmod3E9QA62 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lmod3E9QA62 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lmod3E9QA62 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lmod3E9QA62 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lmod3E9QA62 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lmod3E9QA62 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lmod3E9QA62 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lmod3E9QA62 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lmod3E9QA62 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lmod3E9QA62 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmod3E9QA62 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmod3E9QA62 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmod3E9QA62 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmod3E9QA62 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmod3E9QA62 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmod3E9QA62 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmod3E9QA62 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmod3E9QA62 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmod3E9QA62 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmod3E9QA62 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmod3E9QA62 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmod3E9QA62 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmod3E9QA62 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmod3E9QA62 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmod3E9QA62 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmod3E9QA62 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmod3E9QA62 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmod3E9QA62 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmod3E9QA62 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmod3E9QA62 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmod3E9QA62 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmod3E9QA62 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmod3E9QA62 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmod3E9QA62 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmod3E9QA62 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmod3E9QA62 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmod3E9QA62 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmod3E9QA62 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmod3E9QA62 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmod3E9QA62 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmod3E9QA62 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmod3E9QA62 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmod3E9QA62 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Lmod3E9QA62 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmod3E9QA62 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmod3E9QA62 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmod3E9QA62 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmod3E9QA62 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmod3E9QA62 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmod3E9QA62 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmod3E9QA62 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmod3E9QA62 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmod3E9QA62 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmod3E9QA62 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmod3E9QA62 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmod3E9QA62 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmod3E9QA62 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms