Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7E4

Gm8882, Predicted gene 8882, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8882E9Q7E4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm8882E9Q7E4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm8882E9Q7E4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm8882E9Q7E4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm8882E9Q7E4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm8882E9Q7E4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm8882E9Q7E4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm8882E9Q7E4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm8882E9Q7E4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm8882E9Q7E4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm8882E9Q7E4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm8882E9Q7E4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm8882E9Q7E4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm8882E9Q7E4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm8882E9Q7E4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm8882E9Q7E4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm8882E9Q7E4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm8882E9Q7E4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm8882E9Q7E4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm8882E9Q7E4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm8882E9Q7E4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm8882E9Q7E4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm8882E9Q7E4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm8882E9Q7E4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm8882E9Q7E4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm8882E9Q7E4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm8882E9Q7E4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm8882E9Q7E4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm8882E9Q7E4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm8882E9Q7E4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm8882E9Q7E4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm8882E9Q7E4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm8882E9Q7E4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm8882E9Q7E4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm8882E9Q7E4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm8882E9Q7E4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm8882E9Q7E4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm8882E9Q7E4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm8882E9Q7E4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm8882E9Q7E4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm8882E9Q7E4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm8882E9Q7E4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm8882E9Q7E4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm8882E9Q7E4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm8882E9Q7E4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm8882E9Q7E4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm8882E9Q7E4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8882E9Q7E4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8882E9Q7E4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8882E9Q7E4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8882E9Q7E4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8882E9Q7E4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8882E9Q7E4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8882E9Q7E4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm8882E9Q7E4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm8882E9Q7E4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm8882E9Q7E4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm8882E9Q7E4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm8882E9Q7E4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm8882E9Q7E4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm8882E9Q7E4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm8882E9Q7E4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm8882E9Q7E4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm8882E9Q7E4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm8882E9Q7E4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm8882E9Q7E4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm8882E9Q7E4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm8882E9Q7E4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm8882E9Q7E4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm8882E9Q7E4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm8882E9Q7E4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm8882E9Q7E4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm8882E9Q7E4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm8882E9Q7E4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm8882E9Q7E4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm8882E9Q7E4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm8882E9Q7E4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm8882E9Q7E4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm8882E9Q7E4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm8882E9Q7E4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm8882E9Q7E4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm8882E9Q7E4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm8882E9Q7E4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm8882E9Q7E4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm8882E9Q7E4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm8882E9Q7E4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm8882E9Q7E4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm8882E9Q7E4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm8882E9Q7E4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm8882E9Q7E4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm8882E9Q7E4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm8882E9Q7E4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm8882E9Q7E4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm8882E9Q7E4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm8882E9Q7E4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm8882E9Q7E4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm8882E9Q7E4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm8882E9Q7E4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm8882E9Q7E4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm8882E9Q7E4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms