Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E5

Srsf11, Serine/arginine-rich-splicing factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf11E9Q6E5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Srsf11E9Q6E5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Srsf11E9Q6E5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Srsf11E9Q6E5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srsf11E9Q6E5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srsf11E9Q6E5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srsf11E9Q6E5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srsf11E9Q6E5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srsf11E9Q6E5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srsf11E9Q6E5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srsf11E9Q6E5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srsf11E9Q6E5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srsf11E9Q6E5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srsf11E9Q6E5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srsf11E9Q6E5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srsf11E9Q6E5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Srsf11E9Q6E5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srsf11E9Q6E5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srsf11E9Q6E5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srsf11E9Q6E5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srsf11E9Q6E5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srsf11E9Q6E5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srsf11E9Q6E5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srsf11E9Q6E5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srsf11E9Q6E5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srsf11E9Q6E5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srsf11E9Q6E5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srsf11E9Q6E5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srsf11E9Q6E5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srsf11E9Q6E5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srsf11E9Q6E5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srsf11E9Q6E5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Srsf11E9Q6E5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Srsf11E9Q6E5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Srsf11E9Q6E5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Srsf11E9Q6E5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Srsf11E9Q6E5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Srsf11E9Q6E5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Srsf11E9Q6E5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Srsf11E9Q6E5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Srsf11E9Q6E5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Srsf11E9Q6E5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms