Protein–RNA interactions for Protein: E9PWP9

4931408C20Rik, RIKEN cDNA 4931408C20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931408C20RikE9PWP9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
4931408C20RikE9PWP9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
4931408C20RikE9PWP9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
4931408C20RikE9PWP9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
4931408C20RikE9PWP9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
4931408C20RikE9PWP9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
4931408C20RikE9PWP9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
4931408C20RikE9PWP9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
4931408C20RikE9PWP9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
4931408C20RikE9PWP9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
4931408C20RikE9PWP9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
4931408C20RikE9PWP9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
4931408C20RikE9PWP9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
4931408C20RikE9PWP9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
4931408C20RikE9PWP9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
4931408C20RikE9PWP9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
4931408C20RikE9PWP9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
4931408C20RikE9PWP9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
4931408C20RikE9PWP9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
4931408C20RikE9PWP9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
4931408C20RikE9PWP9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
4931408C20RikE9PWP9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
4931408C20RikE9PWP9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
4931408C20RikE9PWP9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
4931408C20RikE9PWP9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
4931408C20RikE9PWP9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
4931408C20RikE9PWP9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
4931408C20RikE9PWP9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
4931408C20RikE9PWP9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
4931408C20RikE9PWP9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
4931408C20RikE9PWP9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
4931408C20RikE9PWP9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
4931408C20RikE9PWP9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
4931408C20RikE9PWP9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
4931408C20RikE9PWP9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
4931408C20RikE9PWP9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
4931408C20RikE9PWP9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
4931408C20RikE9PWP9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
4931408C20RikE9PWP9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
4931408C20RikE9PWP9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
4931408C20RikE9PWP9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
4931408C20RikE9PWP9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
4931408C20RikE9PWP9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
4931408C20RikE9PWP9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
4931408C20RikE9PWP9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
4931408C20RikE9PWP9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
4931408C20RikE9PWP9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
4931408C20RikE9PWP9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
4931408C20RikE9PWP9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
4931408C20RikE9PWP9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
4931408C20RikE9PWP9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
4931408C20RikE9PWP9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
4931408C20RikE9PWP9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
4931408C20RikE9PWP9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
4931408C20RikE9PWP9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
4931408C20RikE9PWP9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
4931408C20RikE9PWP9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
4931408C20RikE9PWP9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
4931408C20RikE9PWP9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
4931408C20RikE9PWP9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
4931408C20RikE9PWP9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
4931408C20RikE9PWP9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
4931408C20RikE9PWP9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
4931408C20RikE9PWP9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
4931408C20RikE9PWP9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
4931408C20RikE9PWP9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
4931408C20RikE9PWP9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
4931408C20RikE9PWP9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
4931408C20RikE9PWP9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
4931408C20RikE9PWP9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
4931408C20RikE9PWP9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
4931408C20RikE9PWP9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
4931408C20RikE9PWP9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4931408C20RikE9PWP9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4931408C20RikE9PWP9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
4931408C20RikE9PWP9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4931408C20RikE9PWP9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4931408C20RikE9PWP9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4931408C20RikE9PWP9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4931408C20RikE9PWP9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4931408C20RikE9PWP9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
4931408C20RikE9PWP9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4931408C20RikE9PWP9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4931408C20RikE9PWP9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
4931408C20RikE9PWP9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
4931408C20RikE9PWP9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
4931408C20RikE9PWP9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4931408C20RikE9PWP9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4931408C20RikE9PWP9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4931408C20RikE9PWP9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
4931408C20RikE9PWP9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
4931408C20RikE9PWP9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
4931408C20RikE9PWP9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
4931408C20RikE9PWP9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
4931408C20RikE9PWP9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
4931408C20RikE9PWP9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
4931408C20RikE9PWP9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
4931408C20RikE9PWP9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
4931408C20RikE9PWP9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
4931408C20RikE9PWP9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms