Protein–RNA interactions for Protein: E9PWL0

Trim30d, Tripartite motif-containing 30D, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30dE9PWL0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim30dE9PWL0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim30dE9PWL0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim30dE9PWL0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim30dE9PWL0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim30dE9PWL0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim30dE9PWL0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim30dE9PWL0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim30dE9PWL0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim30dE9PWL0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim30dE9PWL0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim30dE9PWL0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim30dE9PWL0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim30dE9PWL0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim30dE9PWL0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim30dE9PWL0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim30dE9PWL0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim30dE9PWL0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim30dE9PWL0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim30dE9PWL0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim30dE9PWL0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim30dE9PWL0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Trim30dE9PWL0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim30dE9PWL0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim30dE9PWL0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim30dE9PWL0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim30dE9PWL0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim30dE9PWL0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim30dE9PWL0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim30dE9PWL0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim30dE9PWL0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim30dE9PWL0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim30dE9PWL0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim30dE9PWL0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim30dE9PWL0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim30dE9PWL0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim30dE9PWL0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim30dE9PWL0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim30dE9PWL0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim30dE9PWL0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim30dE9PWL0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim30dE9PWL0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim30dE9PWL0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim30dE9PWL0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim30dE9PWL0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim30dE9PWL0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim30dE9PWL0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim30dE9PWL0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim30dE9PWL0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim30dE9PWL0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim30dE9PWL0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim30dE9PWL0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim30dE9PWL0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim30dE9PWL0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim30dE9PWL0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim30dE9PWL0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim30dE9PWL0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim30dE9PWL0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim30dE9PWL0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim30dE9PWL0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim30dE9PWL0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim30dE9PWL0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim30dE9PWL0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim30dE9PWL0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim30dE9PWL0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim30dE9PWL0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim30dE9PWL0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim30dE9PWL0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim30dE9PWL0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trim30dE9PWL0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim30dE9PWL0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim30dE9PWL0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim30dE9PWL0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim30dE9PWL0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim30dE9PWL0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim30dE9PWL0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim30dE9PWL0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim30dE9PWL0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim30dE9PWL0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim30dE9PWL0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim30dE9PWL0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim30dE9PWL0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim30dE9PWL0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim30dE9PWL0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim30dE9PWL0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim30dE9PWL0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim30dE9PWL0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim30dE9PWL0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim30dE9PWL0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim30dE9PWL0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim30dE9PWL0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim30dE9PWL0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim30dE9PWL0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim30dE9PWL0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim30dE9PWL0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim30dE9PWL0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim30dE9PWL0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim30dE9PWL0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim30dE9PWL0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim30dE9PWL0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms