Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FgaE9PV24 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FgaE9PV24 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FgaE9PV24 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FgaE9PV24 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FgaE9PV24 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FgaE9PV24 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FgaE9PV24 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FgaE9PV24 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FgaE9PV24 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FgaE9PV24 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FgaE9PV24 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FgaE9PV24 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FgaE9PV24 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FgaE9PV24 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FgaE9PV24 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FgaE9PV24 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FgaE9PV24 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FgaE9PV24 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FgaE9PV24 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FgaE9PV24 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FgaE9PV24 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FgaE9PV24 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FgaE9PV24 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FgaE9PV24 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FgaE9PV24 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FgaE9PV24 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FgaE9PV24 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FgaE9PV24 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FgaE9PV24 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FgaE9PV24 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FgaE9PV24 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FgaE9PV24 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FgaE9PV24 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FgaE9PV24 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FgaE9PV24 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FgaE9PV24 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FgaE9PV24 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FgaE9PV24 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FgaE9PV24 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FgaE9PV24 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FgaE9PV24 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FgaE9PV24 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms