Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ26

Kctd18, Potassium channel tetramerisation domain containing 18, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd18E0CZ26 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kctd18E0CZ26 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kctd18E0CZ26 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kctd18E0CZ26 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kctd18E0CZ26 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kctd18E0CZ26 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kctd18E0CZ26 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kctd18E0CZ26 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kctd18E0CZ26 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kctd18E0CZ26 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kctd18E0CZ26 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kctd18E0CZ26 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Kctd18E0CZ26 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kctd18E0CZ26 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kctd18E0CZ26 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kctd18E0CZ26 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kctd18E0CZ26 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kctd18E0CZ26 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kctd18E0CZ26 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kctd18E0CZ26 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kctd18E0CZ26 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kctd18E0CZ26 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kctd18E0CZ26 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kctd18E0CZ26 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kctd18E0CZ26 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kctd18E0CZ26 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Kctd18E0CZ26 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kctd18E0CZ26 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kctd18E0CZ26 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kctd18E0CZ26 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kctd18E0CZ26 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kctd18E0CZ26 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kctd18E0CZ26 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kctd18E0CZ26 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kctd18E0CZ26 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kctd18E0CZ26 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kctd18E0CZ26 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kctd18E0CZ26 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kctd18E0CZ26 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Kctd18E0CZ26 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kctd18E0CZ26 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kctd18E0CZ26 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kctd18E0CZ26 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kctd18E0CZ26 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kctd18E0CZ26 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kctd18E0CZ26 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kctd18E0CZ26 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kctd18E0CZ26 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kctd18E0CZ26 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kctd18E0CZ26 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kctd18E0CZ26 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kctd18E0CZ26 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kctd18E0CZ26 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kctd18E0CZ26 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kctd18E0CZ26 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Kctd18E0CZ26 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kctd18E0CZ26 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kctd18E0CZ26 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kctd18E0CZ26 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kctd18E0CZ26 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kctd18E0CZ26 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kctd18E0CZ26 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kctd18E0CZ26 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kctd18E0CZ26 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kctd18E0CZ26 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Kctd18E0CZ26 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kctd18E0CZ26 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Kctd18E0CZ26 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Kctd18E0CZ26 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Kctd18E0CZ26 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kctd18E0CZ26 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Kctd18E0CZ26 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Kctd18E0CZ26 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Kctd18E0CZ26 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Kctd18E0CZ26 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kctd18E0CZ26 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Kctd18E0CZ26 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Kctd18E0CZ26 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kctd18E0CZ26 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Kctd18E0CZ26 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kctd18E0CZ26 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kctd18E0CZ26 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Kctd18E0CZ26 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kctd18E0CZ26 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Kctd18E0CZ26 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kctd18E0CZ26 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kctd18E0CZ26 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Kctd18E0CZ26 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kctd18E0CZ26 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kctd18E0CZ26 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kctd18E0CZ26 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kctd18E0CZ26 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Kctd18E0CZ26 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kctd18E0CZ26 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kctd18E0CZ26 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Kctd18E0CZ26 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
Kctd18E0CZ26 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kctd18E0CZ26 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Kctd18E0CZ26 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Kctd18E0CZ26 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
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