Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp6ap1lD3Z5W0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp6ap1lD3Z5W0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp6ap1lD3Z5W0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp6ap1lD3Z5W0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp6ap1lD3Z5W0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp6ap1lD3Z5W0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp6ap1lD3Z5W0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp6ap1lD3Z5W0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp6ap1lD3Z5W0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atp6ap1lD3Z5W0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atp6ap1lD3Z5W0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atp6ap1lD3Z5W0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp6ap1lD3Z5W0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp6ap1lD3Z5W0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp6ap1lD3Z5W0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp6ap1lD3Z5W0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp6ap1lD3Z5W0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp6ap1lD3Z5W0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp6ap1lD3Z5W0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp6ap1lD3Z5W0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp6ap1lD3Z5W0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp6ap1lD3Z5W0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp6ap1lD3Z5W0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp6ap1lD3Z5W0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp6ap1lD3Z5W0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp6ap1lD3Z5W0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp6ap1lD3Z5W0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp6ap1lD3Z5W0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp6ap1lD3Z5W0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp6ap1lD3Z5W0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp6ap1lD3Z5W0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp6ap1lD3Z5W0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp6ap1lD3Z5W0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp6ap1lD3Z5W0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp6ap1lD3Z5W0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp6ap1lD3Z5W0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp6ap1lD3Z5W0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp6ap1lD3Z5W0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp6ap1lD3Z5W0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp6ap1lD3Z5W0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp6ap1lD3Z5W0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp6ap1lD3Z5W0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp6ap1lD3Z5W0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp6ap1lD3Z5W0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp6ap1lD3Z5W0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp6ap1lD3Z5W0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp6ap1lD3Z5W0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp6ap1lD3Z5W0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp6ap1lD3Z5W0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp6ap1lD3Z5W0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp6ap1lD3Z5W0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Atp6ap1lD3Z5W0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp6ap1lD3Z5W0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp6ap1lD3Z5W0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp6ap1lD3Z5W0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp6ap1lD3Z5W0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp6ap1lD3Z5W0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp6ap1lD3Z5W0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp6ap1lD3Z5W0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp6ap1lD3Z5W0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp6ap1lD3Z5W0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp6ap1lD3Z5W0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp6ap1lD3Z5W0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp6ap1lD3Z5W0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp6ap1lD3Z5W0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp6ap1lD3Z5W0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp6ap1lD3Z5W0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp6ap1lD3Z5W0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp6ap1lD3Z5W0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp6ap1lD3Z5W0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp6ap1lD3Z5W0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp6ap1lD3Z5W0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp6ap1lD3Z5W0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp6ap1lD3Z5W0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp6ap1lD3Z5W0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp6ap1lD3Z5W0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp6ap1lD3Z5W0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp6ap1lD3Z5W0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp6ap1lD3Z5W0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp6ap1lD3Z5W0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp6ap1lD3Z5W0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms