Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0K6

Rsbn1l, MCG120108, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsbn1lD3Z0K6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsbn1lD3Z0K6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsbn1lD3Z0K6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsbn1lD3Z0K6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsbn1lD3Z0K6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsbn1lD3Z0K6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsbn1lD3Z0K6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsbn1lD3Z0K6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsbn1lD3Z0K6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsbn1lD3Z0K6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsbn1lD3Z0K6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsbn1lD3Z0K6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsbn1lD3Z0K6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsbn1lD3Z0K6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsbn1lD3Z0K6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsbn1lD3Z0K6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsbn1lD3Z0K6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsbn1lD3Z0K6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rsbn1lD3Z0K6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rsbn1lD3Z0K6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rsbn1lD3Z0K6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rsbn1lD3Z0K6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rsbn1lD3Z0K6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rsbn1lD3Z0K6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rsbn1lD3Z0K6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rsbn1lD3Z0K6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rsbn1lD3Z0K6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rsbn1lD3Z0K6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rsbn1lD3Z0K6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rsbn1lD3Z0K6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rsbn1lD3Z0K6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rsbn1lD3Z0K6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rsbn1lD3Z0K6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rsbn1lD3Z0K6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rsbn1lD3Z0K6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rsbn1lD3Z0K6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rsbn1lD3Z0K6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rsbn1lD3Z0K6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rsbn1lD3Z0K6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rsbn1lD3Z0K6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rsbn1lD3Z0K6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rsbn1lD3Z0K6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rsbn1lD3Z0K6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rsbn1lD3Z0K6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rsbn1lD3Z0K6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rsbn1lD3Z0K6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rsbn1lD3Z0K6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rsbn1lD3Z0K6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rsbn1lD3Z0K6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rsbn1lD3Z0K6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rsbn1lD3Z0K6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rsbn1lD3Z0K6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rsbn1lD3Z0K6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rsbn1lD3Z0K6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rsbn1lD3Z0K6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rsbn1lD3Z0K6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rsbn1lD3Z0K6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rsbn1lD3Z0K6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rsbn1lD3Z0K6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rsbn1lD3Z0K6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rsbn1lD3Z0K6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rsbn1lD3Z0K6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rsbn1lD3Z0K6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rsbn1lD3Z0K6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rsbn1lD3Z0K6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rsbn1lD3Z0K6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rsbn1lD3Z0K6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rsbn1lD3Z0K6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rsbn1lD3Z0K6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rsbn1lD3Z0K6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rsbn1lD3Z0K6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rsbn1lD3Z0K6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rsbn1lD3Z0K6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rsbn1lD3Z0K6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rsbn1lD3Z0K6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rsbn1lD3Z0K6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rsbn1lD3Z0K6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rsbn1lD3Z0K6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rsbn1lD3Z0K6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rsbn1lD3Z0K6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rsbn1lD3Z0K6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rsbn1lD3Z0K6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rsbn1lD3Z0K6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rsbn1lD3Z0K6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rsbn1lD3Z0K6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsbn1lD3Z0K6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsbn1lD3Z0K6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsbn1lD3Z0K6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsbn1lD3Z0K6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsbn1lD3Z0K6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsbn1lD3Z0K6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsbn1lD3Z0K6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsbn1lD3Z0K6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsbn1lD3Z0K6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsbn1lD3Z0K6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rsbn1lD3Z0K6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rsbn1lD3Z0K6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rsbn1lD3Z0K6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rsbn1lD3Z0K6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rsbn1lD3Z0K6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms