Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc6D3YZP9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc6D3YZP9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc6D3YZP9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc6D3YZP9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc6D3YZP9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc6D3YZP9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc6D3YZP9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc6D3YZP9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc6D3YZP9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc6D3YZP9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc6D3YZP9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc6D3YZP9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc6D3YZP9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc6D3YZP9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc6D3YZP9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc6D3YZP9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc6D3YZP9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc6D3YZP9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc6D3YZP9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc6D3YZP9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc6D3YZP9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc6D3YZP9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc6D3YZP9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc6D3YZP9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc6D3YZP9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc6D3YZP9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc6D3YZP9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc6D3YZP9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc6D3YZP9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc6D3YZP9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc6D3YZP9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc6D3YZP9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc6D3YZP9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc6D3YZP9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc6D3YZP9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc6D3YZP9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc6D3YZP9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc6D3YZP9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc6D3YZP9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc6D3YZP9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc6D3YZP9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc6D3YZP9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc6D3YZP9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc6D3YZP9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc6D3YZP9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc6D3YZP9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc6D3YZP9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc6D3YZP9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc6D3YZP9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc6D3YZP9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc6D3YZP9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc6D3YZP9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc6D3YZP9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc6D3YZP9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc6D3YZP9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc6D3YZP9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc6D3YZP9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Ccdc6D3YZP9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Ccdc6D3YZP9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc6D3YZP9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc6D3YZP9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc6D3YZP9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc6D3YZP9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc6D3YZP9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc6D3YZP9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc6D3YZP9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc6D3YZP9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc6D3YZP9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc6D3YZP9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc6D3YZP9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc6D3YZP9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc6D3YZP9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc6D3YZP9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc6D3YZP9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc6D3YZP9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc6D3YZP9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc6D3YZP9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc6D3YZP9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc6D3YZP9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc6D3YZP9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc6D3YZP9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc6D3YZP9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc6D3YZP9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc6D3YZP9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc6D3YZP9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc6D3YZP9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc6D3YZP9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc6D3YZP9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc6D3YZP9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc6D3YZP9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc6D3YZP9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc6D3YZP9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc6D3YZP9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc6D3YZP9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc6D3YZP9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc6D3YZP9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc6D3YZP9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms