Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usf3B2RUQ2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Usf3B2RUQ2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Usf3B2RUQ2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usf3B2RUQ2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usf3B2RUQ2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usf3B2RUQ2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usf3B2RUQ2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usf3B2RUQ2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usf3B2RUQ2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usf3B2RUQ2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usf3B2RUQ2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usf3B2RUQ2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usf3B2RUQ2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usf3B2RUQ2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usf3B2RUQ2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Usf3B2RUQ2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usf3B2RUQ2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usf3B2RUQ2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usf3B2RUQ2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usf3B2RUQ2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usf3B2RUQ2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usf3B2RUQ2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Usf3B2RUQ2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usf3B2RUQ2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usf3B2RUQ2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usf3B2RUQ2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Usf3B2RUQ2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Usf3B2RUQ2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usf3B2RUQ2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usf3B2RUQ2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usf3B2RUQ2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usf3B2RUQ2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms