Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prrt4B2RU40 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prrt4B2RU40 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prrt4B2RU40 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prrt4B2RU40 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prrt4B2RU40 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrt4B2RU40 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrt4B2RU40 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrt4B2RU40 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrt4B2RU40 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrt4B2RU40 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrt4B2RU40 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrt4B2RU40 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prrt4B2RU40 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prrt4B2RU40 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prrt4B2RU40 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prrt4B2RU40 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prrt4B2RU40 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prrt4B2RU40 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prrt4B2RU40 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prrt4B2RU40 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prrt4B2RU40 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prrt4B2RU40 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prrt4B2RU40 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prrt4B2RU40 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prrt4B2RU40 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Prrt4B2RU40 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prrt4B2RU40 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prrt4B2RU40 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Prrt4B2RU40 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prrt4B2RU40 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prrt4B2RU40 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prrt4B2RU40 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prrt4B2RU40 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Prrt4B2RU40 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prrt4B2RU40 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prrt4B2RU40 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prrt4B2RU40 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prrt4B2RU40 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prrt4B2RU40 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prrt4B2RU40 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prrt4B2RU40 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prrt4B2RU40 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms