Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Znf518bB2RRE4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf518bB2RRE4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf518bB2RRE4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf518bB2RRE4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf518bB2RRE4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Znf518bB2RRE4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf518bB2RRE4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf518bB2RRE4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Znf518bB2RRE4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf518bB2RRE4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf518bB2RRE4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Znf518bB2RRE4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf518bB2RRE4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf518bB2RRE4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf518bB2RRE4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Znf518bB2RRE4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf518bB2RRE4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Znf518bB2RRE4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf518bB2RRE4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Znf518bB2RRE4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf518bB2RRE4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Znf518bB2RRE4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Znf518bB2RRE4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf518bB2RRE4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf518bB2RRE4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Znf518bB2RRE4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Znf518bB2RRE4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf518bB2RRE4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf518bB2RRE4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Znf518bB2RRE4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Znf518bB2RRE4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf518bB2RRE4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf518bB2RRE4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf518bB2RRE4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf518bB2RRE4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf518bB2RRE4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf518bB2RRE4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf518bB2RRE4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf518bB2RRE4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf518bB2RRE4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf518bB2RRE4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf518bB2RRE4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf518bB2RRE4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf518bB2RRE4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf518bB2RRE4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf518bB2RRE4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf518bB2RRE4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf518bB2RRE4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf518bB2RRE4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf518bB2RRE4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf518bB2RRE4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf518bB2RRE4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf518bB2RRE4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf518bB2RRE4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf518bB2RRE4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf518bB2RRE4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf518bB2RRE4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf518bB2RRE4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf518bB2RRE4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf518bB2RRE4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf518bB2RRE4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf518bB2RRE4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf518bB2RRE4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf518bB2RRE4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf518bB2RRE4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf518bB2RRE4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf518bB2RRE4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf518bB2RRE4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf518bB2RRE4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf518bB2RRE4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf518bB2RRE4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf518bB2RRE4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf518bB2RRE4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf518bB2RRE4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf518bB2RRE4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf518bB2RRE4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf518bB2RRE4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf518bB2RRE4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf518bB2RRE4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf518bB2RRE4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf518bB2RRE4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf518bB2RRE4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf518bB2RRE4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf518bB2RRE4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf518bB2RRE4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf518bB2RRE4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf518bB2RRE4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf518bB2RRE4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf518bB2RRE4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf518bB2RRE4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf518bB2RRE4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf518bB2RRE4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf518bB2RRE4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf518bB2RRE4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf518bB2RRE4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf518bB2RRE4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf518bB2RRE4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf518bB2RRE4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf518bB2RRE4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms