Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB3

Gm438, MCG65768, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm438B1ASB3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm438B1ASB3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm438B1ASB3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm438B1ASB3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm438B1ASB3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm438B1ASB3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm438B1ASB3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm438B1ASB3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm438B1ASB3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm438B1ASB3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm438B1ASB3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm438B1ASB3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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