Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3173A6NAS3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3173A6NAS3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3173A6NAS3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3173A6NAS3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3173A6NAS3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3173A6NAS3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3173A6NAS3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3173A6NAS3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3173A6NAS3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3173A6NAS3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3173A6NAS3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3173A6NAS3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3173A6NAS3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm3173A6NAS3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm3173A6NAS3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm3173A6NAS3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm3173A6NAS3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm3173A6NAS3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm3173A6NAS3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm3173A6NAS3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm3173A6NAS3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm3173A6NAS3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3173A6NAS3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3173A6NAS3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3173A6NAS3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3173A6NAS3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3173A6NAS3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3173A6NAS3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3173A6NAS3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3173A6NAS3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3173A6NAS3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm3173A6NAS3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm3173A6NAS3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm3173A6NAS3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm3173A6NAS3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm3173A6NAS3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm3173A6NAS3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm3173A6NAS3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm3173A6NAS3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm3173A6NAS3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm3173A6NAS3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gm3173A6NAS3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3173A6NAS3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3173A6NAS3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3173A6NAS3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3173A6NAS3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3173A6NAS3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3173A6NAS3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3173A6NAS3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3173A6NAS3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm3173A6NAS3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm3173A6NAS3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Gm3173A6NAS3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm3173A6NAS3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm3173A6NAS3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm3173A6NAS3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm3173A6NAS3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm3173A6NAS3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm3173A6NAS3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm3173A6NAS3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm3173A6NAS3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm3173A6NAS3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm3173A6NAS3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm3173A6NAS3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm3173A6NAS3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm3173A6NAS3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm3173A6NAS3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm3173A6NAS3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm3173A6NAS3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm3173A6NAS3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm3173A6NAS3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm3173A6NAS3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm3173A6NAS3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm3173A6NAS3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm3173A6NAS3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm3173A6NAS3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm3173A6NAS3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm3173A6NAS3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm3173A6NAS3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm3173A6NAS3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm3173A6NAS3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm3173A6NAS3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm3173A6NAS3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm3173A6NAS3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm3173A6NAS3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm3173A6NAS3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm3173A6NAS3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm3173A6NAS3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm3173A6NAS3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm3173A6NAS3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm3173A6NAS3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm3173A6NAS3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm3173A6NAS3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm3173A6NAS3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm3173A6NAS3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm3173A6NAS3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm3173A6NAS3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm3173A6NAS3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm3173A6NAS3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms