Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9E4

Ttll2, Probable tubulin polyglutamylase TTLL2, mousemouse

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll2A4Q9E4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttll2A4Q9E4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttll2A4Q9E4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttll2A4Q9E4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttll2A4Q9E4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttll2A4Q9E4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttll2A4Q9E4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttll2A4Q9E4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttll2A4Q9E4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttll2A4Q9E4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttll2A4Q9E4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttll2A4Q9E4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttll2A4Q9E4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttll2A4Q9E4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttll2A4Q9E4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttll2A4Q9E4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttll2A4Q9E4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttll2A4Q9E4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttll2A4Q9E4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttll2A4Q9E4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttll2A4Q9E4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttll2A4Q9E4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttll2A4Q9E4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttll2A4Q9E4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttll2A4Q9E4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttll2A4Q9E4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttll2A4Q9E4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttll2A4Q9E4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttll2A4Q9E4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttll2A4Q9E4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttll2A4Q9E4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttll2A4Q9E4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttll2A4Q9E4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttll2A4Q9E4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttll2A4Q9E4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttll2A4Q9E4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttll2A4Q9E4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttll2A4Q9E4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttll2A4Q9E4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttll2A4Q9E4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttll2A4Q9E4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttll2A4Q9E4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttll2A4Q9E4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttll2A4Q9E4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttll2A4Q9E4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttll2A4Q9E4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttll2A4Q9E4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttll2A4Q9E4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll2A4Q9E4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll2A4Q9E4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll2A4Q9E4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll2A4Q9E4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll2A4Q9E4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll2A4Q9E4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll2A4Q9E4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll2A4Q9E4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll2A4Q9E4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll2A4Q9E4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll2A4Q9E4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll2A4Q9E4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttll2A4Q9E4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttll2A4Q9E4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttll2A4Q9E4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttll2A4Q9E4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttll2A4Q9E4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll2A4Q9E4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll2A4Q9E4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll2A4Q9E4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll2A4Q9E4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll2A4Q9E4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll2A4Q9E4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll2A4Q9E4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll2A4Q9E4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll2A4Q9E4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll2A4Q9E4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll2A4Q9E4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll2A4Q9E4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll2A4Q9E4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttll2A4Q9E4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttll2A4Q9E4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttll2A4Q9E4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttll2A4Q9E4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttll2A4Q9E4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttll2A4Q9E4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttll2A4Q9E4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttll2A4Q9E4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttll2A4Q9E4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttll2A4Q9E4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll2A4Q9E4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll2A4Q9E4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll2A4Q9E4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll2A4Q9E4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll2A4Q9E4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll2A4Q9E4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll2A4Q9E4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll2A4Q9E4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll2A4Q9E4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttll2A4Q9E4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttll2A4Q9E4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttll2A4Q9E4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms