Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Odf2A3KGV1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Odf2A3KGV1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Odf2A3KGV1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Odf2A3KGV1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Odf2A3KGV1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Odf2A3KGV1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Odf2A3KGV1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Odf2A3KGV1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Odf2A3KGV1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Odf2A3KGV1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Odf2A3KGV1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Odf2A3KGV1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Odf2A3KGV1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Odf2A3KGV1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Odf2A3KGV1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Odf2A3KGV1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Odf2A3KGV1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Odf2A3KGV1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Odf2A3KGV1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Odf2A3KGV1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Odf2A3KGV1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Odf2A3KGV1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Odf2A3KGV1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Odf2A3KGV1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Odf2A3KGV1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Odf2A3KGV1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Odf2A3KGV1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Odf2A3KGV1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Odf2A3KGV1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Odf2A3KGV1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Odf2A3KGV1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Odf2A3KGV1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Odf2A3KGV1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Odf2A3KGV1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Odf2A3KGV1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Odf2A3KGV1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Odf2A3KGV1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Odf2A3KGV1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Odf2A3KGV1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Odf2A3KGV1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Odf2A3KGV1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Odf2A3KGV1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Odf2A3KGV1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Odf2A3KGV1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Odf2A3KGV1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Odf2A3KGV1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Odf2A3KGV1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Odf2A3KGV1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Odf2A3KGV1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Odf2A3KGV1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Odf2A3KGV1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Odf2A3KGV1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Odf2A3KGV1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Odf2A3KGV1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Odf2A3KGV1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Odf2A3KGV1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Odf2A3KGV1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Odf2A3KGV1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Odf2A3KGV1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Odf2A3KGV1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Odf2A3KGV1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Odf2A3KGV1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Odf2A3KGV1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Odf2A3KGV1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Odf2A3KGV1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Odf2A3KGV1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Odf2A3KGV1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Odf2A3KGV1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Odf2A3KGV1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Odf2A3KGV1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Odf2A3KGV1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Odf2A3KGV1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Odf2A3KGV1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Odf2A3KGV1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Odf2A3KGV1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Odf2A3KGV1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Odf2A3KGV1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Odf2A3KGV1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Odf2A3KGV1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Odf2A3KGV1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Odf2A3KGV1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Odf2A3KGV1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Odf2A3KGV1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Odf2A3KGV1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Odf2A3KGV1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Odf2A3KGV1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Odf2A3KGV1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Odf2A3KGV1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Odf2A3KGV1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Odf2A3KGV1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Odf2A3KGV1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Odf2A3KGV1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Odf2A3KGV1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Odf2A3KGV1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Odf2A3KGV1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Odf2A3KGV1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Odf2A3KGV1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Odf2A3KGV1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Odf2A3KGV1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms