Protein–RNA interactions for Protein: A2ARI4

Lgr4, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr4A2ARI4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lgr4A2ARI4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lgr4A2ARI4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lgr4A2ARI4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lgr4A2ARI4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lgr4A2ARI4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lgr4A2ARI4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lgr4A2ARI4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lgr4A2ARI4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lgr4A2ARI4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lgr4A2ARI4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lgr4A2ARI4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lgr4A2ARI4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lgr4A2ARI4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lgr4A2ARI4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lgr4A2ARI4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lgr4A2ARI4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lgr4A2ARI4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lgr4A2ARI4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Lgr4A2ARI4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lgr4A2ARI4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lgr4A2ARI4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lgr4A2ARI4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lgr4A2ARI4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lgr4A2ARI4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lgr4A2ARI4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lgr4A2ARI4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lgr4A2ARI4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lgr4A2ARI4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lgr4A2ARI4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lgr4A2ARI4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lgr4A2ARI4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lgr4A2ARI4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Lgr4A2ARI4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Lgr4A2ARI4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lgr4A2ARI4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lgr4A2ARI4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lgr4A2ARI4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lgr4A2ARI4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lgr4A2ARI4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lgr4A2ARI4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lgr4A2ARI4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lgr4A2ARI4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lgr4A2ARI4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lgr4A2ARI4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lgr4A2ARI4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lgr4A2ARI4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lgr4A2ARI4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lgr4A2ARI4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lgr4A2ARI4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lgr4A2ARI4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lgr4A2ARI4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lgr4A2ARI4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lgr4A2ARI4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lgr4A2ARI4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lgr4A2ARI4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lgr4A2ARI4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lgr4A2ARI4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lgr4A2ARI4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lgr4A2ARI4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Lgr4A2ARI4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lgr4A2ARI4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lgr4A2ARI4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lgr4A2ARI4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lgr4A2ARI4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lgr4A2ARI4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lgr4A2ARI4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Lgr4A2ARI4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lgr4A2ARI4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lgr4A2ARI4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lgr4A2ARI4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lgr4A2ARI4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Lgr4A2ARI4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lgr4A2ARI4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lgr4A2ARI4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lgr4A2ARI4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lgr4A2ARI4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lgr4A2ARI4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lgr4A2ARI4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lgr4A2ARI4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lgr4A2ARI4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lgr4A2ARI4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Lgr4A2ARI4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lgr4A2ARI4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lgr4A2ARI4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lgr4A2ARI4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lgr4A2ARI4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lgr4A2ARI4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lgr4A2ARI4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lgr4A2ARI4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lgr4A2ARI4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Lgr4A2ARI4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lgr4A2ARI4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lgr4A2ARI4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lgr4A2ARI4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lgr4A2ARI4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lgr4A2ARI4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lgr4A2ARI4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Lgr4A2ARI4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lgr4A2ARI4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms