Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lcn6A2AJB9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lcn6A2AJB9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lcn6A2AJB9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lcn6A2AJB9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lcn6A2AJB9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lcn6A2AJB9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lcn6A2AJB9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lcn6A2AJB9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lcn6A2AJB9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lcn6A2AJB9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lcn6A2AJB9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lcn6A2AJB9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lcn6A2AJB9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lcn6A2AJB9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lcn6A2AJB9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lcn6A2AJB9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lcn6A2AJB9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lcn6A2AJB9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lcn6A2AJB9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lcn6A2AJB9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lcn6A2AJB9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lcn6A2AJB9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lcn6A2AJB9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lcn6A2AJB9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lcn6A2AJB9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lcn6A2AJB9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lcn6A2AJB9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lcn6A2AJB9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lcn6A2AJB9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lcn6A2AJB9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lcn6A2AJB9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lcn6A2AJB9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Lcn6A2AJB9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lcn6A2AJB9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lcn6A2AJB9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lcn6A2AJB9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lcn6A2AJB9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lcn6A2AJB9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lcn6A2AJB9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lcn6A2AJB9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lcn6A2AJB9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lcn6A2AJB9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lcn6A2AJB9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lcn6A2AJB9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lcn6A2AJB9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lcn6A2AJB9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lcn6A2AJB9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lcn6A2AJB9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lcn6A2AJB9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lcn6A2AJB9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Lcn6A2AJB9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lcn6A2AJB9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lcn6A2AJB9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lcn6A2AJB9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Lcn6A2AJB9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lcn6A2AJB9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lcn6A2AJB9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lcn6A2AJB9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lcn6A2AJB9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lcn6A2AJB9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lcn6A2AJB9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Lcn6A2AJB9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lcn6A2AJB9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lcn6A2AJB9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lcn6A2AJB9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lcn6A2AJB9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lcn6A2AJB9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lcn6A2AJB9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lcn6A2AJB9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Lcn6A2AJB9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lcn6A2AJB9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lcn6A2AJB9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lcn6A2AJB9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lcn6A2AJB9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lcn6A2AJB9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lcn6A2AJB9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lcn6A2AJB9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lcn6A2AJB9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lcn6A2AJB9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lcn6A2AJB9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lcn6A2AJB9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lcn6A2AJB9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lcn6A2AJB9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lcn6A2AJB9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Lcn6A2AJB9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lcn6A2AJB9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lcn6A2AJB9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lcn6A2AJB9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lcn6A2AJB9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lcn6A2AJB9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lcn6A2AJB9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Lcn6A2AJB9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lcn6A2AJB9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Lcn6A2AJB9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lcn6A2AJB9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Lcn6A2AJB9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lcn6A2AJB9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lcn6A2AJB9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lcn6A2AJB9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms