Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cldn34dA2AGU5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms