Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc163A2AGD7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc163A2AGD7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc163A2AGD7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc163A2AGD7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc163A2AGD7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc163A2AGD7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc163A2AGD7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc163A2AGD7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc163A2AGD7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc163A2AGD7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc163A2AGD7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc163A2AGD7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc163A2AGD7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc163A2AGD7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc163A2AGD7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc163A2AGD7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc163A2AGD7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc163A2AGD7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc163A2AGD7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc163A2AGD7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc163A2AGD7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc163A2AGD7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc163A2AGD7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc163A2AGD7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc163A2AGD7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc163A2AGD7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc163A2AGD7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc163A2AGD7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc163A2AGD7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc163A2AGD7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc163A2AGD7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc163A2AGD7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc163A2AGD7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc163A2AGD7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc163A2AGD7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc163A2AGD7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc163A2AGD7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc163A2AGD7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc163A2AGD7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc163A2AGD7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc163A2AGD7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc163A2AGD7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc163A2AGD7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc163A2AGD7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc163A2AGD7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc163A2AGD7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc163A2AGD7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc163A2AGD7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc163A2AGD7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc163A2AGD7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc163A2AGD7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc163A2AGD7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc163A2AGD7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc163A2AGD7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc163A2AGD7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc163A2AGD7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc163A2AGD7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc163A2AGD7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc163A2AGD7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc163A2AGD7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc163A2AGD7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc163A2AGD7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc163A2AGD7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc163A2AGD7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc163A2AGD7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc163A2AGD7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc163A2AGD7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc163A2AGD7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc163A2AGD7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc163A2AGD7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc163A2AGD7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc163A2AGD7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc163A2AGD7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc163A2AGD7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc163A2AGD7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc163A2AGD7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc163A2AGD7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc163A2AGD7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc163A2AGD7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc163A2AGD7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc163A2AGD7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc163A2AGD7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc163A2AGD7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc163A2AGD7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc163A2AGD7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc163A2AGD7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc163A2AGD7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc163A2AGD7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc163A2AGD7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc163A2AGD7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc163A2AGD7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc163A2AGD7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc163A2AGD7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc163A2AGD7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc163A2AGD7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc163A2AGD7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc163A2AGD7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc163A2AGD7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc163A2AGD7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms