Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rhbdl2A2AGA4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rhbdl2A2AGA4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rhbdl2A2AGA4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rhbdl2A2AGA4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rhbdl2A2AGA4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rhbdl2A2AGA4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rhbdl2A2AGA4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rhbdl2A2AGA4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rhbdl2A2AGA4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rhbdl2A2AGA4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rhbdl2A2AGA4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rhbdl2A2AGA4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rhbdl2A2AGA4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rhbdl2A2AGA4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rhbdl2A2AGA4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rhbdl2A2AGA4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rhbdl2A2AGA4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rhbdl2A2AGA4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rhbdl2A2AGA4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rhbdl2A2AGA4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rhbdl2A2AGA4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rhbdl2A2AGA4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Rhbdl2A2AGA4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rhbdl2A2AGA4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rhbdl2A2AGA4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rhbdl2A2AGA4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rhbdl2A2AGA4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rhbdl2A2AGA4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rhbdl2A2AGA4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rhbdl2A2AGA4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rhbdl2A2AGA4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rhbdl2A2AGA4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rhbdl2A2AGA4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rhbdl2A2AGA4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rhbdl2A2AGA4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rhbdl2A2AGA4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rhbdl2A2AGA4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rhbdl2A2AGA4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rhbdl2A2AGA4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms