Protein–RNA interactions for Protein: A2AF53

Tmem185a, Transmembrane protein 185A, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem185aA2AF53 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem185aA2AF53 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms