Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GRH6

Zscan4-ps3, Zinc finger and SCAN domain containing 4, pseudogene 3, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms