Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G8

Trbv2, T cell receptor beta, variable 2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv2A0A0B4J1G8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trbv2A0A0B4J1G8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trbv2A0A0B4J1G8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trbv2A0A0B4J1G8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trbv2A0A0B4J1G8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trbv2A0A0B4J1G8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trbv2A0A0B4J1G8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trbv2A0A0B4J1G8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trbv2A0A0B4J1G8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trbv2A0A0B4J1G8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trbv2A0A0B4J1G8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trbv2A0A0B4J1G8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trbv2A0A0B4J1G8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trbv2A0A0B4J1G8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trbv2A0A0B4J1G8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trbv2A0A0B4J1G8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trbv2A0A0B4J1G8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trbv2A0A0B4J1G8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trbv2A0A0B4J1G8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trbv2A0A0B4J1G8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trbv2A0A0B4J1G8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trbv2A0A0B4J1G8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trbv2A0A0B4J1G8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trbv2A0A0B4J1G8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trbv2A0A0B4J1G8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trbv2A0A0B4J1G8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trbv2A0A0B4J1G8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trbv2A0A0B4J1G8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trbv2A0A0B4J1G8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trbv2A0A0B4J1G8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trbv2A0A0B4J1G8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trbv2A0A0B4J1G8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trbv2A0A0B4J1G8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trbv2A0A0B4J1G8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trbv2A0A0B4J1G8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trbv2A0A0B4J1G8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Trbv2A0A0B4J1G8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
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