Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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