Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Psma1Q9R1P4 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Psma1Q9R1P4 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Psma1Q9R1P4 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Psma1Q9R1P4 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Psma1Q9R1P4 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Psma1Q9R1P4 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Psma1Q9R1P4 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Psma1Q9R1P4 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Psma1Q9R1P4 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Psma1Q9R1P4 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Psma1Q9R1P4 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Psma1Q9R1P4 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Psma1Q9R1P4 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Psma1Q9R1P4 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Psma1Q9R1P4 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Psma1Q9R1P4 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Psma1Q9R1P4 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Psma1Q9R1P4 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Psma1Q9R1P4 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Psma1Q9R1P4 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Psma1Q9R1P4 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Psma1Q9R1P4 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Psma1Q9R1P4 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Psma1Q9R1P4 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Psma1Q9R1P4 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Psma1Q9R1P4 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Psma1Q9R1P4 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Psma1Q9R1P4 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Psma1Q9R1P4 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Psma1Q9R1P4 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Psma1Q9R1P4 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Psma1Q9R1P4 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Psma1Q9R1P4 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Psma1Q9R1P4 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Psma1Q9R1P4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Psma1Q9R1P4 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Psma1Q9R1P4 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Psma1Q9R1P4 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Psma1Q9R1P4 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Psma1Q9R1P4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Psma1Q9R1P4 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Psma1Q9R1P4 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Psma1Q9R1P4 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms