Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

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Length 917 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Ercc4Q9QZD4 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ercc4Q9QZD4 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ercc4Q9QZD4 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ercc4Q9QZD4 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ercc4Q9QZD4 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ercc4Q9QZD4 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Ercc4Q9QZD4 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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