Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PolkQ9QUG2 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PolkQ9QUG2 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PolkQ9QUG2 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PolkQ9QUG2 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PolkQ9QUG2 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PolkQ9QUG2 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PolkQ9QUG2 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PolkQ9QUG2 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PolkQ9QUG2 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PolkQ9QUG2 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PolkQ9QUG2 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PolkQ9QUG2 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PolkQ9QUG2 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PolkQ9QUG2 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PolkQ9QUG2 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PolkQ9QUG2 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PolkQ9QUG2 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PolkQ9QUG2 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PolkQ9QUG2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PolkQ9QUG2 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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PolkQ9QUG2 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PolkQ9QUG2 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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