Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms