Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
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Smg9Q9DB90 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Smg9Q9DB90 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Smg9Q9DB90 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Smg9Q9DB90 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Smg9Q9DB90 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Smg9Q9DB90 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Smg9Q9DB90 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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