Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Efhd1Q9D4J1 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms