Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms