Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms