Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCZ8

Rpusd1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd1Q8VCZ8 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rpusd1Q8VCZ8 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rpusd1Q8VCZ8 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rpusd1Q8VCZ8 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rpusd1Q8VCZ8 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rpusd1Q8VCZ8 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rpusd1Q8VCZ8 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rpusd1Q8VCZ8 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rpusd1Q8VCZ8 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rpusd1Q8VCZ8 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rpusd1Q8VCZ8 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rpusd1Q8VCZ8 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rpusd1Q8VCZ8 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms