Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Ehmt1-202ENSMUST00000091348 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Tanc1-203ENSMUST00000112568 7422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Chd8-212ENSMUST00000200169 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Nrp2-205ENSMUST00000114155 6534 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Nktr-201ENSMUST00000035112 7022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Zfp451-202ENSMUST00000044455 11876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Dhdh-201ENSMUST00000011526 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Cxcl12-201ENSMUST00000073043 5627 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Cntnap2-205ENSMUST00000199100 6279 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Itgam-203ENSMUST00000106242 4649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Cgnl1-201ENSMUST00000072899 6754 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms