Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUJ9

Lrp12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp12Q8BUJ9 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrp12Q8BUJ9 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms