Protein–RNA interactions for Protein: Q8BNE1

Tcaf1, TRPM8 channel-associated factor 1, mousemouse

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Length 924 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf1Q8BNE1 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Tcaf1Q8BNE1 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tcaf1Q8BNE1 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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