Protein–RNA interactions for Protein: Q64446

Atp7b, Copper-transporting ATPase 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp7bQ64446 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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Atp7bQ64446 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp7bQ64446 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp7bQ64446 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Atp7bQ64446 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp7bQ64446 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp7bQ64446 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp7bQ64446 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp7bQ64446 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp7bQ64446 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp7bQ64446 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Atp7bQ64446 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Atp7bQ64446 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp7bQ64446 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp7bQ64446 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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Atp7bQ64446 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp7bQ64446 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp7bQ64446 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp7bQ64446 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp7bQ64446 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp7bQ64446 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp7bQ64446 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp7bQ64446 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp7bQ64446 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp7bQ64446 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp7bQ64446 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp7bQ64446 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp7bQ64446 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp7bQ64446 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp7bQ64446 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp7bQ64446 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp7bQ64446 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp7bQ64446 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp7bQ64446 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp7bQ64446 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp7bQ64446 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp7bQ64446 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms