Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Gm28047Q3US59 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Gm28047Q3US59 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Gm28047Q3US59 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Gm28047Q3US59 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Gm28047Q3US59 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Gm28047Q3US59 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Gm28047Q3US59 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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