Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl9Q32KG4 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms