Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Taf1bP97358 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Taf1bP97358 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Taf1bP97358 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Taf1bP97358 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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